Україна стала членом Всесвітньої організації охорони здоров'я в 1948 році. З придбанням незалежності в 1991 році поновила своє активне членство.
У відповідності з Постановою Кабінету Міністрів України від 04.04.2001 № 327 «Про Єдиний державний реєстр міжнародних організацій, членом яких є Україна» Міністерство охорони здоров'я України визначено центральним органом виконавчої влади, який відповідає за координацію діяльності Всесвітньої організації охорони здоров'я в Україні.
Дворічні Угоди про співробітництво укладаються з 1994 року та обумовлюють напрямки співробітництва на дворічний термін, погоджують стратегію наступної роботи, визначають найбільш хворобливі проблеми охорони громадського здоров'я, які мають потребу в мобілізації національних зусиль і допомоги з боку ВООЗ.
